تعمل وزارة البيئة على إقامة تآزر بينها وبين القطاعات الوزارية الأخرى من خلال توقيع اتفاقيات شراكة إطارية لتنفيذ نشاطات مشتركة لحماية البيئة لتحقيق الأهداف المحددة مسبقًا، ويتجسد هذا من خلال توقيع العديد من الاتفاقيات:
اتفاقية شراكة مع وزارة التربية الوطنية لتعزيز التربية البيئية من اجل التنمية المستدامة في الوسط التربوي،
اتفاقية شراكة مع وزارة العدل لإعادة الإدماج الاجتماعي للمحبوسين،
اتفاقية شراكة مع وزارة الاتصال لتكوين الصحافيين في مجال البيئة،
اتفاقية شراكة مع وزارة السكن والعمران والمدينة لتنفيذ خريطة الطريق الخاصة بتحسين الإطار المعيشي على مستوى الأحياء الحضرية والمدن الجديدة،
اتفاقية شراكة مع وزارة التكوين والتعليم المهنيين لترقية التكوين والتعليم المهنيين في المهن المطورة المرتبطة بالبيئة.
اتفاقية شراكة مع وزارة السياحة والصناعات التقليدية لترقية السياحة البيئية.
اتفاقية شراكة مع وزارة التعليم العالي والبحث العلمي من أجل تنفيذ برامج التعليم والبحث العلمي في مجال حماية البيئة والتنمية المستدامة.
اتفاقية تعاون مع وزارة الصيد البحري والموارد الصيدية لتحسين وتعزيز مراقبة جودة الأوساط المائية وحالتها الإيكولوجية الجيدة، للحفاظ على النظم الإيكولوجية المائية البحرية والساحلية واستغلال مواردها البيولوجية بطريقة مستدامة.